Gene Detail

1.Annotation (Gramene)

Annotation: Fructose-bisphosphate aldolase

2.Location

Chromosome	Strand	Region	Start	End	UCSC
3	+	gene	27392126	27395824	LINK

3.Sequences

Gene:

>GRMZM2G089365

CACACCTCGTCTGCCACCAACCCACCTCCTAGTTCCTGTTTCAGGACGCTTATTATTCTCCGCCGTTGGCGTCGTGAAGCCCGAAGACACCGATCTCACGGACAAACTTACAACATATGGCTATGGCGACGGCGAAGCTGAACTCCCCGGCTACCAGCTTGGTCGCTGGCGGCCGCACGCGCCGATCTGCGCCCGCCCGCTGCACGACGGTGATCCGCGCCGCCGCAGGCTCCTACTCGGACGAGCTCATCTCCACCGCGGTGAGCCCCCCATTCCCCACAACCAAACCCTACATCTGTCCTTTCAGTATGAGTGTATTGACTGCCGGCCGGAGGATCTTGTTTTTGGAGTGTTGCACGTGTCTTACGCGGCGATCTGTGTTGTGGTGATGATCGTTGTTATCTGTCATCTGTGAACGGTGATGGGGACTGTTCGGCAGGACTAGGATGATGAGGAAGACACTGATATTTTTTCTTTTGGTTTATTCGATTCAAATTTAGGTTGAAGAAACATTTTCTTGGTGCCTGTTCGTTGCGATACATAGGTATACATGTCAACATCTTGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGCATAGTGTTCAGTCACAGACTGCTTTACTTGAATGCAAGCTGCATTGCTCGTCGCTTTCTTCTCCATTTATTAAGCAAATTTGAGACGCCAGATGCCTTCAAAAGCACTTAAGAAATTAAGTAGTGTGCACATATATATTTTTTATTTAGAGATTTCCAGTTGTGGTGCAGAAAATCATGCTTCTTGTGCTTGTATCAGTTCAAAGATCCCATGCAAAATCAGAAATATAGAATACTTGAATTGAATTGAGTTAATTGACCATGTTCACACTAACTTCATTGTTTCTGGTCACTCCTAGAGTCTTAATAGTACTCATGTGAATAGTGTGCTTATTGATGGGTGTTAGTTTTGGTGAACTGAATACGAACAACAATGCACCTACTTTCTCTTATTGCTTATTTTGTGATCCAGTTATGGTTACTAATTTATTAATATGATTTATGACTATCTTGGTTATCTATCTGCCTTTGGGCAGGCACTTAAAAATATAGTCTGCCTCATTCTTATTAGCATGGACTTCACAGGAATGTTGATCTGAAAACAATATGAAACTGCTAGGGTTACCGGTTACCAAATTGGTTTAACTGTTTAAGGGCAATACAAGTATTGACCTTTTATTCTATTTTTGGCTTCTTAAACGTAATAGCTACTCATTAAAATACTGATGTGTGATTCTCTGCATCTAATTTCTGATTAATTTTTCAATGCAAGGATCTACCATGTGCAAACTTTACAAGAAGTGCTAAAGCGTGAATTTGGTACCTTCTCTGTATACTGTGGATATGTTAGAGCTTATGCGATATTAACTGTAATGCTTCTTTATTTGTGTTTGTTGATAGTAAGTTAGTGCAAGCATGTGAACCATATTTTTGAGTTATGTGTTCAGCTATTGGAACTGACACTCGTCATTGTTTGATTGGTTGAACCTGGGTATGGTAATATGTTCTTCTAAGTTTGAAATCATTCTCCTTTTCCACTATTTCTTCTTTCTTCACCGTGATGCATTTTTCTGTTGGTTTTTGTGAATGCTAATCTAATGGTTGTAACTTTCGTCGGCAGAAATCTGTTGCTTCCCCTGGGCGTGGTATTCTGGCAATTGATGAGTCAAATGCAACATGTGGAAAGAGGTTATCATCTATTGGTTTGGACAACACAGAAGTGAACCGCCAGGCTTACAGGCAGCTTTTGCTGACAACTGCTGGTCTTGGTGAATATATTTCTGGCGCTATTCTTTTCGAGGAGACCCTTTATCAATCAACTACAGACGGCAAGAAGTTTGTTGACTGCTTGAAGGATCAGAATATCATGCCTGGCATCAAGGTTGACAAGGTATGCATGCCATGATCTTATAACATCATGTTAGCCCACAAATTGCTTCTATCATTATGATTCTCACTGCCTGATTGCTTTGGTTTCATGAATCAGGGTTTGGTTCCATTGCCTGGATCCAACAATGAATCATGGTGCCAAGGTCTTGATGGTTTGGCTTCAAGGTGTGCTGAGTACTATAAGCAGGGGGCGCGCTTCGCAAAGTGGTCTGTTCATACTTCCCTTATTCATGTGTCAACTAATCTTATTTGTGCTTCCTTTCTAAAGTTGCTATGATTATCGGTCTTCTCTAGGAGGACTGTTGTTAGCATCCCTTGTGGTCCATCTGCATTAGCAGTCAAGGAAGCAGCATGGGGACTTGCTCGATATGCTGCTATTGCTCAGGTAACAAAATAAACTGCAACTGTGGAAACATCTTGCAATATTTTTTTGATGACTCATGGAGCTTTGGTGAAGAACCTATCTGCATTCGTATGGGCACACATTAGTCGTGCTGCAGTTACTGTGGATAGAAAGACGTATTTTAACGGGGCTCAGAATTTGTTTGTTGTTCAACCTGAGGTGTTTATAAACATCTAATACATCCTGTTCCAAACTATAAGACGTTTTGACTTTTATAGATTCATAGCTTTTGTTGTGTTCTTAGATATACACTATGTCTATATATATAATAAAAACATTGTATCTAGAAAAGCCAAAACATCTTATGATTTGAACTGAGGGATTATGTTTAGGTGCGCAGCAAGCTTAACAAGTTAATATGCACTTCTAGTTTAGCTGACGCCACATATGTATTCTTGATTTCTTGAATGAAATAAAAAGGAATGATATATTGTAATATTTACAACAAACTCTTACAAACTTGTTTATCATGCTTCAACATGAATAATCTACAGGATAATGGTTTAGTGCCAATTGTGGAGCCAGAGATTCTTCTTGATGGAGACCATGGGATCGAGGGAGCTCTTGAGGTGGCAGAGAAAGTGTGGTCTGAGGTGTTTTTCTACTTAGCCGAGAACAATGTTCTGTTTGAGGGTATCCTGCTGAAGCCTAGCATGGTCACCCCTGGAGCTGAGCACAAGGAGAAGGCTTCTCCAGAAGCCATTGCAAAGTACACGCTAACAATGCTCAGAAGGAGAGTACCTCCCGCTGTTCCTGGAATCATGGTATCATCTTGACTCTTGGAGCAAATAATCTGCATATAAAGTCAGATCATCAATCGTTATAATTGATTTTCTCTGCAGTTCCTTTCTGGTGGACAGTCCGAGGTGGAGGCAACTCTGAACCTGAATGCAATGAACCAGTCTCTGAACCCATGGCATGTGTCGTTCTCCTATGCCCGGGCTCTGCAGAACTCGGTGCTGAAGACATGGCAAGGGCGCCCTGAGAACGTGGAGGCAGCGCAGAAGGCCCTGCTGGTGCGCGCAAAGGCCAACTCGCTGGCCCAGCTCGGTCGCTACACTGGTGAGGGCGAGAGCGATGATGCCAAGAAAGGCATGTTCCAGAAGGGCTACACCTACTAATGTGCCAGCGAGATGTTTCCATGACATAATAATAATTGTAGCGTTTTGGTGTTATTATTATTATTATTTTGGTACGCTCTGGTGAATAATAACCAAATTGTTGGTGCCAACGACATCTAGCAGCAAATTGGTCTTTAGAACTCATGTAGAACCTTGAGAACGAACATGTAATCTGGTGAATTCTATTCCTATATTTGAGGCGATGGATGCTAAGTTGCCATATGCGACAAGCACAACAGGTGATTTATGTTCTTTTATGT

Promoter(up TSS 3kb):

>GRMZM2G089365_promoter

ACGACAAAGAATCCCCTGATTGGTTGATTTCCTTTTCTGTGGGGCACCTGACCGTCCCGTGCGCCATGTGACCGTTGGCACTCGTCGACGTGGCAGATAGTCGTTGCATGGCTGGAGCACCGGACTGTCCAGCGCCTCGCGCAGACTGTCCGGTGATTTATAGCCGACGTAGCTAGGAAAACCCCGAGAGCAGGGAGTTTGCGCAGACCGTGCACTGGACTGTCCGGTGAGTGGCTCCGGACCGTCCGGTGCTGCGCAGTCCAGCACCTTTTCTTTGTTTCTTTATTTGTCTTCTTTTGATTCTTTTGGACTTCACTTAGCTGAGTTCCTGGCACATAGACAAGAGTGTTTATCATATAAAATAATTGACCAAGCGTCTAGAGCTTACCTTTATTCTTTATTTGCATCTCTTTAACACTTGGCACAAATCACCTTAATACAATATGTGTTGGGCATCTAATCACCAAAATATTTATAGAAATGGCCCAAGGGCACATTTCCCTTTCACCCTCGGGACAAACTCCGCCTCTCCTGAGCATGGCCTCGGCTACCTGCTCCCCCACAAATCCTACGGAAGGCCACTCCTTCAACTATGGCGCACGCCATCGGATCTTAGGACGGGCTCGGTCACGACCTCGGGCGGACTTCCGCCTCGCCCAAGCCCGGTTCTGCCCTCGATATCTGTGATGGAGGATGCCCCCAACGTCATCAGATATAGTGAAGTTGATGCATCCCTTAAGAATCTTTTTCCCATGCTTAGCACTGTGTCAACCACTACGATATGGATAACCCCTTGCCAGGGGGCTCGGGTACGTGACTGAGCCCTCGGCCTCGGCCTCGGTGCTCAGCAGCAAACAAGCGGGCACAAGTCAACATCAAAGTACAAGGCCATACCTTCTACAGGATACAAAGACACCCCTTCACAGTATGCAGCCAACTCCCATCCTCCAGGAAGCTCCCCTTGAGCCTATAAATAGGGTAGTCTATGGTTTCTGAAGGGCAGACGAACACTTCACAAGTTTTCTCCCCCACTCGGTATTGGCACTTGCCTCAATCATCCCCTAAGACTTGGGATTCTTCCCTCTCTCGCTCTGCTCGTAAACCCTACTACAAGCACTTAGGTGCGAGCAATATAAGTCTCATCCCCTCTGCTGTAAGTAGGGCCTCTTCTAGCCCGAACCAGGATAAAGGACTTGTGTCAACTTGCATCACCATCTGGGTCTGGGGCACACGACATTATTTCACTAGTTTGTTAGGTCCACGGATTCAAACACCGAAAGTAAGAAAGTTCTAGTTTTGGATTAATTTTTTAAATAACCTATTCACCCCCTCTAGTCGACATCCAGATCTGTGTTGCCCTCAAAGGGAACTTTCAGATTTGTTCTCCCTTTCTCTAAGTTCTTGATCTTCACTTGTGATATTGCCCTTGAACTAATTCCACAATTAAGTTGGGAATCAAGTGCAAGAATATCTTCCTTCTCTTACTCTCTTGTACTTAAATTTTATGCTAACCATTAATTTGACATCCAAGTTTATTTTGGGTTGTGAATATTCAGGTGTCACCTATTCACCCTCCTCTAGGTGACTATCAATTTGGTATTAGAGCCCGACACTTCTTTTTGACTTTAACCACTTGAAGTGATGTCGGGAGAAAACGAGAAGGCACCATTGGAGGACTTGAACAAGGATAAGGCACCCCTAGAAGGAAATGGAGAGAAGCCCACCAGATCAAGCTCCAAGAAGAATGATGGCAAGAAAAAACAAATCAAGAAGATCGTATACTACGAGATGAATTCTTCTACATCATCATCCACGTCGAGCAAAGAAGAATCCACATCCAAGCATTGCCAAAATACGGTTAAACAAAATTATTCTAAAACATCTCTTTAACTATTTTCACATTCCTAGAAATTTAAATGTCTAATTGTTTTTGGTTCCTCTCGGTAAACCACCTCACTATGATGGTGAGGACTACTCTTGGTGGAGTCACAAATAAAGAACCATTTATATTCACTCTAACTAAGTATTTGGGATATTGTTGAATCAGGAATGAAGATTCCCGAGAGCGATGATGGAAAGTACAATTTGGTGGAGGTAGGGTCGAAAACGGATGGGATAAATCTCATACCGACCCGTACCATTTCCCACATTTGACCGGTCTGTTTCCGAATTTGTGGAAACCGTTCACGTTAGATGACCGTTGCTGATTAACCGTTGTCGACCGTTGCCAGGTTGTCCATTGCATCAAACCCGAGGTCCGATGCGCCAGCTGACAGAGTGCTCGAAAAATCCTTCTCCGCGCAAGTGGTCCGGCGACCCAGTCCAGTGCATATAAGCGAGGCCCGGTGCACCAAGAAGCAACACACTTCTTTATTCTTCAATCTTCTTTATTTGTGCTCTTCTAGTCTTGGACATATGCTGAATATTTGTATATCTTCTATGGGTCTTCTAATACCTTCTTTGAAGCGTTGCTAACCTAATGTCTTAGTCCAAGTCCACTTTGTATTATGTAATTAAATAAAAGCATAATAAATAGCAATGAAAACATATATAATTATTTAGAAACACATCATATAGGATAGGAAGAATAGAGAGCCTTATGAAGTTGCTCTAAGCATCTCCAATAGTTGTGTAAATTTAGTACTTATATTATAGATTTAGAAAGTTGCTAAAACAGTTTAAAAAGTAAAAAAAAATATTCATACGCTCCAATAGTTCTCTTTTTTGGTTGCCAATTTTTTAAAATTATCCATCAACAAAAAATAAGTAGGTCTATTTTCTATTTTTAATTGACTATCGATGTAAGATCATACGATCGCGACGACGGTATGAAAACCTCTGACAGTGCCTCGATATATGAGATTGTCTGACGGTGACAATGTTAAGATGTCTAAACGTTAGAGATAGATTTGTGGTCAACATGGTGATACGTCACCCTCAATTTTTTTTAAAAAAAACTTGTTAAATTATAATTATTAGAAAGTTGTTTACGTAATATGT

Transcript:

>GRMZM2G089365_T01

>GRMZM2G089365_T02

TTTTTCTGTTGGTTTTTGTGAATGCTAATCTAATGGTTGTAACTTTCGTCGGCAGAAATCTGTTGCTTCCCCTGGGCGTGGTATTCTGGCAATTGATGAGTCAAATGCAACATGTGGAAAGAGGTTATCATCTATTGGTTTGGACAACACAGAAGTGAACCGCCAGGCTTACAGGCAGCTTTTGCTGACAACTGCTGGTCTTGGTGAATATATTTCTGGCGCTATTCTTTTCGAGGAGACCCTTTATCAATCAACTACAGACGGCAAGAAGTTTGTTGACTGCTTGAAGGATCAGAATATCATGCCTGGCATCAAGGTTGACAAGGTATGCATGCCATGATCTTATAACATCATGTTAGCCCACAAATTGCTTCTATCATTATGATTCTCACTGCCTGATTGCTTTGGTTTCATGAATCAGGGTTTGGTTCCATTGCCTGGATCCAACAATGAATCATGGTGCCAAGGTCTTGATGGTTTGGCTTCAAGGTGTGCTGAGTACTATAAGCAGGGGGCGCGCTTCGCAAAGTGGTCTGTTCATACTTCCCTTATTCATGTGTCAACTAATCTTATTTGTGCTTCCTTTCTAAAGTTGCTATGATTATCGGTCTTCTCTAGGAGGACTGTTGTTAGCATCCCTTGTGGTCCATCTGCATTAGCAGTCAAGGAAGCAGCATGGGGACTTGCTCGATATGCTGCTATTGCTCAGGTAACAAAATAAACTGCAACTGTGGAAACATCTTGCAATATTTTTTTGATGACTCATGGAGCTTTGGTGAAGAACCTATCTGCATTCGTATGGGCACACATTAGTCGTGCTGCAGTTACTGTGGATAGAAAGACGTATTTTAACGGGGCTCAGAATTTGTTTGTTGTTCAACCTGAGGTGTTTATAAACATCTAATACATCCTGTTCCAAACTATAAGACGTTTTGACTTTTATAGATTCATAGCTTTTGTTGTGTTCTTAGATATACACTATGTCTATATATATAATAAAAACATTGTATCTAGAAAAGCCAAAACATCTTATGATTTGAACTGAGGGATTATGTTTAGGTGCGCAGCAAGCTTAACAAGTTAATATGCACTTCTAGTTTAGCTGACGCCACATATGTATTCTTGATTTCTTGAATGAAATAAAAAGGAATGATATATTGTAATATTTACAACAAACTCTTACAAACTTGTTTATCATGCTTCAACATGAATAATCTACAGGATAATGGTTTAGTGCCAATTGTGGAGCCAGAGATTCTTCTTGATGGAGACCATGGGATCGAGGGAGCTCTTGAGGTGGCAGAGAAAGTGTGGTCTGAGGTGTTTTTCTACTTAGCCGAGAACAATGTTCTGTTTGAGGGTATCCTGCTGAAGCCTAGCATGGTCACCCCTGGAGCTGAGCACAAGGAGAAGGCTTCTCCAGAAGCCATTGCAAAGTACACGCTAACAATGCTCAGAAGGAGAGTACCTCCCGCTGTTCCTGGAATCATGGTATCATCTTGACTCTTGGAGCAAATAATCTGCATATAAAGTCAGATCATCAATCGTTATAATTGATTTTCTCTGCAGTTCCTTTCTGGTGGACAGTCCGAGGTGGAGGCAACTCTGAACCTGAATGCAATGAACCAGTCTCTGAACCCATGGCATGTGTCGTTCTCCTATGCCCGGGCTCTGCAGAACTCGGTGCTGAAGACATGGCAAGGGCGCCCTGAGAACGTGGAGGCAGCGCAGAAGGCCCTGCTGGTGCGCGCAAAGGCCAACTCGCTGGCCCAGCTCGGTCGCTACACTGGTGAGGGCGAGAGCGATGATGCCAAGAAAGGCATGTTCCAGAAGGGCTACACCTACTAATGTGCCAGCGAGATGTTTCCATGACATAATAATAATTGTAGCGTTTTGGTGTTATTATTATTATTATTTTGGTACGCTCTGGTGAATAATAACCAAATTGTTGGTGCCAACGACATCTAGCAGCAAATTGGTCTTTAGAACTCATGTAGAACCTTGAGAACGAACATGTAATCTGGTGAATTCTATTCCTATATTTGAGGCGATGGATGCTAAGTTGCCATATGCGACAAGCACAACA

CDS:

Protein:

4.Chromatin states

States in Promoter (2kb)	States in Genebody	States in Downstream (2kb)
E23,E26,E23,E11,E23,E6,	E6,E4,E5,E7,E12,E25,E23,E13,E6,E3,E23,E25,E21,	E25,E38,

5.Protein domain

Protein ID	Pfam Accession	Pfam Annotation	Alignment Start	Alignment Start	E-value
GRMZM2G089365_P01	PF00274.16	Glycolytic	43	387	5.20E-158
GRMZM2G089365_P02	PF00274.16	Glycolytic	1	257	2.10E-116

6.Blast top3 hits

Species	Gene ID	Blast Evalue
Arabidopsis thaliana	AT2G01140	0
Arabidopsis thaliana	AT4G38970	0
Arabidopsis thaliana	AT2G21330	0
Oryza sative	LOC_Os01g02880	0
Oryza sative	LOC_Os11g07020	0
Oryza sative	LOC_Os06g40640	3.00E-136

7.Heuristic function module

Category	Family
GO	GO:0004332
GO	GO:0016829
GO	GO:0003824
GO	GO:0009534
GO	GO:0009570
GO	GO:0005739
GO	GO:0010287
GO	GO:0046686
GO	GO:0006096
GO	GO:0006979
Subcellular location	cytosol
Subcellular location	nucleus
Subcellular location	plastid

8.Predicted function module

Category	Family
B73 Global Microarray network	B73MGSE27004CFM275
B73 abiotic stress conditional network	ABIOTICCFM24
Mo17 tissue specific network	MO17RALLCFM412
Mo17 tissue specific network	MO17RALLCFM781
Mo17 tissue specific network	MO17RALLCFM792