Gene Detail

1.Annotation (Gramene)

Annotation: Uncharacterized protein

2.Location

Chromosome	Strand	Region	Start	End	UCSC
10	-	gene	73172286	73173446	LINK

3.Sequences

Gene:

Promoter(up TSS 3kb):

>GRMZM2G343519_promoter

ATAGAATGCCTGAAATACATTCTTGAAAGTGTGTATTAAGACCTAAAGGATTAGTTTTCTAAACCCATGCAAAATAAACTTAGTAATTCTTTGTGTATACTAGTCTCTGGCTCCTCCCAACAAATATGCAATTGTCTAGAAAAAAATGGTTGTGAACATTTCTTGTAAGGATTCAACGGGGATTGATATTATTTTGTTAGACCTTACATCGATCCAATAAAAGATGTGAACCTAAGGTATGATTCATTTTCATAATAATTGACAAGTTTATAAGAACCATTGGTTCCATGTTTAGCATTGATGGATGTATTCCTACCCACTTGGGACCAAAACTCAAATTTAATGTTGTACATGTATCATTATTGCGACTATTTATTTTTAGCCGTCCAAGGACATGCTAGCGAACAACGAGGTGTTTGTGGTATCATTGTCAATATCAATATTTGTTGGTCCAATCTCACAAACGTGTTTCAAAATGGTATGGTGTGCATGGCTTCCTTAATCCCAAGATAATTAGTTCGATTTCATTAGGGGCTCATAGGGTTAGGATTTATGTGTTTATCTAAGCATTTGCATATGTACACAAATTTTTTTAAAAAAAGACATGTTTCCTAATTTAAGCTTTGCACATTTATCAGTTGAAGGTGCTAATTTTAATAATTTACTATGGTTTAAACTAGGTTGGTGGTCATATATATGAATTATAAGTATGATAAACATCAACCATAAAAATAATCTTTTCCTCTACATCACAGATACCATAAAATGAATCTTTTGTTCTATATCATGGATACCATAAAATGAATCTTTTGCTCTATACCATGGGTATGAGCATAAATTTCTTTGGACTCATTTAGGAGTCATAGAATTCAACCTTTCATTAAACTCTAGCGATGTCAAGGATAGTTAGGTACCTATATCAAGACGAAAGTTAGTTTCGAAAATTTTGTCATAGCTCATAACTGACTTTATGATCTTCGTTTGTGGTAGACACTCATTGTGAGGATTTAGTGCATATGGTCAAAGGATGTATATGATGTTAGTGATACTAGAGTATTAGATCATAACTCATTGATAAAATTTTACGTCTCATTTTTACCTTTTCCAAACTCTTGTAAAGTGGTAAATTAAATAATGGCTACTTTTATCAATATAACTTAAAACATATATTTTTATCTGAGTGATTAAATGTATATTTTACTACTTTACCCGTCTACATCTTTATAAAAATATGTATTAAATAGATTATTTTCATTTTCCCAACTAGTATAGTTGTTTTCTAGTCTCTAGATGAGCTATCATAGACGTCGTACTATTATAGGAGTATTTAAATATTAAGTATTACAATTAACCTTGGTCAACAAAACATATTGGTTTTTTTTCTAAAATACAAATGAACCAATAAAATACTATTATATTCTATGTGCTCACAAATAGTACAAAATTAAACGCATCATTGTAAACAATTGCTCTATACATCCTCCACCCCAAAAAAATTGTACAATTTAATTTAGCAATCTAAAACTATATTCGAACCGTTCTCATATTTCATCCATATTACCTATCCTTAAATTATATCCCCAAGACCTCTAAAGTAGTACTCATTATGTTCGAATTTATAACTCGTTTATACTAAGTTTGATCGACTTATCTTATTAAAAAATATGTACGATTATTATTAATTTTTAGTGTAGAATCATTTAGCATATAATATACTTTAAGTATGGTTTTATTTTTTTTATTTTTGCAAAAAAATTTAAAAACAAGGCGACCAAACTTGGTAAAAAATTCAAACGAATTATAAATTGATATAGATGTAGTATATATAATTATTTATGTGGAATTTTAGCATTTACGGTTAAGAGTTGGGTAAGTCCTATTTCTTTGTGCACGCATATTTTGTAGATTTGACTACGGTGCATGTGCTTTATTGGATATGGTATCCAATACTTAAACTTATGATGGATCCAAGTATGTTCCTTTGTATATGGTGAATCATAGGTTTCTAATTTGAAGCTTCGCATATGAATCAATTAGTTTCATTCAGTAGGTTGAAGGTCTCAAATTTGAATCTTTATTAGGATTCAACTAAGGTATATCATGCGTTTCAACTTGAATTTTGTTAAGTATATCACCTACAAATGAATCCTTTTCTCTAAAATGTTTAAACTAAAAGCTTGTTTTTTTATTTGTGAGTCATAGAATTCAATTTTTTTCTTCGAAATTTAGTGAAGTTAAGAATACACAATATCTTCATCTAGAGGGGTGGTTGCCTTTTGAAATTTTGGTTGCAAGTGACGTCCATATTTCCGGTGAGTGACATGGACAGTCTTCCATTTGCGCCGAACATTTATTAGGGATTTATTTTTCCTGTCAAACACTCAAATCGCTAATTCTTAACTCAATGAAGAACACATTTTCTAGTTGAATATATTTTGAACAATTTTTTGTTGCTATTCACACCCTAGCTTGTAGAAAAGGTAAAATCAATTCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTATTTTGTTGAACTGGATAGTTGTGTTCTGAGTTTTTCTGGATGAGCTGCAGTCTGCAGAATAAGGACTTGCCTTCCATAACCTCACTACAGTTGATGTGTGTTTGGTGTTTTTATGAATTGTGAGCAAATGAACTAACTTTCGGCAGTGTTTAAGTATACTAATCAATGCCATAAAAAATTTATATGCAAAACCAATTGAATTTTCTTTTCTCGAATTCAAATTAGCCACCCACCAGATTTCTACTAAATTATCCTATGCTCCAAAAAAAGTAAAAATTAAACTGCATCCACCTAATCACAGCTCTATTCTTACATTTCTCCTAAAAAGTTGTTAAATACTACAGGCAAATTCTTATCGTAATCCATTATTCACCGGTTCATCTGAACCCGTACTCCCATTAAATCGTAACCCTGCACGTGTGGGTGCACGTCCGGCCGACG

Transcript:

CDS:

Protein:

4.Chromatin states

States in Promoter (2kb)	States in Genebody	States in Downstream (2kb)
E26,E23,E24,E23,E2	E2,E13	E25,E13,E25,E20,E17,E11,E11,E3,E11

5.Protein domain

Protein ID	Pfam Accession	Pfam Annotation	Alignment Start	Alignment Start	E-value
GRMZM2G343519_P01	PF00462.21	Glutaredoxin	205	272	1.20E-11

6.Blast top3 hits

Species	Gene ID	Blast Evalue
Arabidopsis thaliana	AT5G39865	8.00E-36
Arabidopsis thaliana	AT3G57070	2.00E-35
Arabidopsis thaliana	AT3G28850	2.00E-33
Oryza sative	LOC_Os04g54860	3.00E-48
Oryza sative	LOC_Os02g51370	1.00E-35
Oryza sative	LOC_Os08g07450	9.00E-34

7.Heuristic function module

Category	Family
GO	GO:0015035
GO	GO:0009055
GO	GO:0045454
Subcellular location	cytosol
Subcellular location	nucleus
Subcellular location	plastid

8.Predicted function module

Category	Family
B73 Global Microarray network	B73MGSE27004CFM453