Gene Detail

1.Annotation (Gramene)

Annotation: Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase

2.Location

Chromosome	Strand	Region	Start	End	UCSC
9	-	gene	134182737	134185295	LINK

3.Sequences

Gene:

>GRMZM2G426964

TGTAGATGCCGGACATGACAACCAAGAAGGGATGGTTAGATTAAATTCTAGGATGTCACAAATAGAGGTAAAATTTGATCTCATAACTGTTTCTGAATCTTTTGGGGTACTTGAAATAGAAATCCCATTCATTAAGTTCCATCACACCCATTTTTGTTTCACAGGGCATTGGTGCTGCAAACAGAATATTCTACCTTGCTGTTCCACAAGAGGCACTCCTTGATGTAGCATTGCCACTGGCTGACGGTGCCCAAACTAAGCAAGGCTGGAATAGAATAATTATCGAGAAACCATTTGGCTTTACTGGTTTGTCCTCACTGCGGGTAACACAATCTATGCTGTCAAGGTTTGAGGAGAAGCAAATTTACAGGTACTATTCCACCTTTAATGTTTAATCCTTTCAACCTTAACTCCAACATAAAATTTGGTCCCACGGGGAGTCAAACCCAGGACTTGAGTGCTAATGAGGCCATCTAACCAATTGAGCTAGACACCCATTCACATTCCTTCCAACCTTAGCTGGTTTTCCCTTTTTTGGATTGTTCAATTACGAAGCTTGACATTTTTATCCCATAGGATTGACCACCTTCTGGGGAAGGATCTGATCGAAAATCTTACTGTCTTGAGATTTTCTAACTTGGTGTTTGAACCTTTGTGGAGTCGAACTTACATACGGAATGTGCAGGTACACTTCAAAAGTCATTTTGCACATGCTTTATTATCTTGTATATACATGAATCATGTAGTAATGTGTGTGAATTGTGTCAGGTCATTTTTTCTGAAGAAACATCAAATGAAATACAAGGGAGGTGAGTTAATCCTATTGAATTGCCTTAACAGCATTGAATGTTATAAAACCATACATGTTATCACAAACTCTAGGCTAACTCTGCGTGAGTAGGTCATTATTAGGTTTGTTTGAACTTTACAATAGTCTCTTCTGTTTAACCTTTGAAATTATCTCTTATCTTGGTTCTCTTTATTGAAAACCGATTCATGTTTCGGCATTCTAATTCTGGATCATTTAGTTCAAAACCATATGCCCTTGCAGGTACTTTGGAAATTATGGGATAATCCGTGACATAGTTCACAGCCACATTCTTCAAACAATAGCTCTATTTGCTATGGAACCACCTGTAAGTCTTGATGGAGAGGATATCCGAGATGAAAAGGTAAGGTGGTATAATTTTTTAACATAGGAAATCGGCACTACTGTGCTAGATGGAAGTTAGAAAGCGCTGGCTTTGATACAGGATCATAAGAACTACCACTTATGCAGGTGAAGGTTCTCAGATCAATTCGGAAAGTGAACCTTGATGATGTTGTTCTTGGTCAACTTAAAGATATGTCTGGTAAAGTTGACAGATACACAAAATCCATGATACCAACCTATTTTGCTGCTGCTATGTACATTGACAATGCACGCTGGGATGGGGTACCATTTTTTATCAGGACAGGCATGGGACTTATGACGAATAGGTACGTTAAATGAGTTTCATAACTTTTATCAGGAAATGTCCTAATAGTTTAATTTCTGAATTCAGCCACCTCATTGACTAATTGTCGCGCTGTGCTGTTATGATCTTATTGCATTTCTATAACCTAACATCTCAAAAGGTAGAATCAGGAATCGATTCATATGCAGATAGCATGCTGTTCTATCAAATGTTTCAGTAGTGCACCCTGTTCTGATCACTTTGTTGATAGCCTTTGCAAGGTTGCCACATTTTTATGAAAGAATATTACCAGTTTTTATAGAAAAAAACTACCGTCTGACAAATCGATCAAGCATAACTGAAGTAGTCCAATCATTGATTTCCTTCAGAGCAGAAATTCGAATTCAGTTTCGCCATGTCCCTGGTAATATCTACCGTGAACGCTTTGGCCATGACATAGATCTCGACACAAACGAGCTGGTTCTACGCGATCAACCTGAAGAAGCAATCCTGTTGAAAGTCAACAACAAGGTCCCAGGGCTTGGGCTCCAGCTGGATGCTTCAGAACTGAACCTGCTTTACCGGGATAGGTATGGAGATCTCTTGGATCGCCTTATGATTTATCCATAGAACTGTCATTAAACCATGAACTTTGATGTGTAGGTACAACACCGAGGTACCAGATTCGTATGAACATCTTCTACTGGACGTGCTAGATGGAGATAGTCATTTATTCATGCGCAGCGACGAACTGGCTGCCGCATGGAATGTGCTCACTCCGATAATCCATGAGATAGATCAGAACAGAGTAGTTCCTGAGCTCTACGAGGCTGGGGACAGAGGGCCTATCAATGCTTACCATCTCGCTGCTAAACATGGGGTGCGATGGGATGACGACTGGTGAGTCGATACATGGCAAAGATTCTCGATGCGCAACGAGATTCATTACCAATTTTTGTCGTTGTATCGCAGTCAGATGTACAATATGCCTTCTGTAATCGGCCTGATCAAGGACTTTCAAGGAGACATGCCTTTCAAGGAGATATGCAAACATGGTTTCTTTCCTGTCCTGTAGACTGTAGCACTGTTGATTCAAGTTGGAAAAAGAAAAAAAGGAGAAAAG

Promoter(up TSS 3kb):

>GRMZM2G426964_promoter

TTTCACAAGTTATCTAGGCAAAATTCGAACTTTTTCTAACGCATCGAAGAAGTGCATATGCTTTCGATTCCTGGGGAATTCCGGTATTTTCCATCAAATTCTGGTAAAGCATCCTGGGCTCCTGGCGGTTAGCCAAGAATTCCATCAATTGCTCTATACACGACGTCGTCGACGTGTAATGTAAAGCTACAGCGGTTCAACTTCGACGGCGGCCCCAGCCTCGCTACACTGTCGCTATCCATTTTCCCCGTCACGAGCTGCCATGAGCAATTAAGTCTTCTTCACTTCCTGGTTCCCAGTATTGGTCGAGGCGATCTGACGGAGGGAGCAGCCAAGTCAGCAAGTACCGCAGCACCAAGCAGTCGAACAGCGCCGAAGATGCCAGGGCTCGCCGCGTCGGCGTCCGCAGCTCCGGCGCCGTTCTCGTTGGCGACCTCGCGCTTAACCCCGGTGAGTACTCGCCACGAGCGGCTGTGGTGCTGTATCCCTGGTCGGTGCTAGGATGCAGAAGTGCTGGTTTTCTTTCCTTCCGGCGCTGCGCGCTTAGCTTGCTCGATGAAATGCATCAACCAATTCGCATGCCGCTGGTGCGGTAGCGTTCTGGAGCAATACGTGCCCGTTGCAGATTCACGGAGTGGGATGGCGAGGCTTTGCTTTGCCAGTGCCAGCTTGTGATCCTAGTGAACCTTTCTGCCCTTCTTGGCTCTGCAACGCAAGTTTATAGCATCATCCATGATCGCGTTTTCGCCACGGGTTCCATATGATGCTGTTTTATTTCCTTCCCTCCCCGGTGCCGGAGGTGGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGCCGCATTAGGGCAGCTCGCCCACTCAACGAGCTGAAGGAGTCTTGGCTCGAAGTATGGCTTACGAGCTGCACCCTAATAAATAAAATTGCATTATATAATGACTTAATAGTATATAAATATGAAAATTATAATTATCATTTAACACTATAAGTAATCTAAATTATAAATTGTCTTATATTCATCGTCAAAGGCTAAGGAATGAGTCAGATAGCTATAAAATTATCTAATATCTATCATTATTATATTGGTTGATTAATTTTGTATAGCCAGCAAGCCGGCTCGCAAGCCGGAACGACGGGCTCGGCTCTTGGCTCGACTCGTTGGACCAACGAGCTTGAAAACCTGGCCTGGCTCGGCTCGCAAGTCGCTCTAAGCCGAGCTCGAGCCGGCTCGCGAACCTCAAGCTTTTTTTCAGCCCTAGGCCACATTGAATTGAACGTGTGACGTATCAACATGCTCCTGTTTGGATATTCGAGAAATGTGGTACACATAAAAAGGTGTGCTGGTTTGATATGAACCGCACACGCTTGGTTGATGGAATTGTTGTTGCATCAATAGTCAATCCATTACACAGGGGCAGATTGTTTGTTGGTTTGAATGCTATGTTTGTTTACGTTGTGCAGTACATGAATAAAAAACTTGTCTCCCTTTCCCCACCATTGGCCAATTGAAGTCTTGCAAAAATTGCTTTGCATTCGGTGGCTGACAGACAAATTTATCACATCCGATTTATTAGGCATTGATGACGGGATGGAGTTTCTTAGCTTACATTATTTGGTAGTTACACATTGCTATATTCATCTATTGATCTTTCTACTTGATGCTTCTTTACATAGGTTGCAAGACCTGCTCCAAGTTTCAGAACGCAAGCTTGTGGATTGAGGTGCTGGATTGCTGCAAAGCTGAAACTCCGCAAGGCATTGAAAAGGCATCACGGATGGCAACTTCAAAGAAATCTAGATGCTCGAGGGAATGATAACGTTCCAGATTGCTTGGAGGCTGCATCTCTGACTGAAAAGAGAAGTCATTGGAACATGCATCTTGCTTATGGTTGTCACTCTATTGGGAAATCCGTTGTCTTGAGTCCGTTACTTTGCATGTGCAGATGTGCTTATCACAGTTGTCATTATTGTCTTAATGCCTTATGATTTCGTCAGTGCTGCTGACACTGGATTGCTTCATACTTTTGATAGTTACATTCAATTTGCATTAGCATTATAAGCAAAAAAATGCTCAAGAGAAACTTTCTTCGTCATATTATCTTACAACTACTTTTTACTGCAAACTTCTTGGCAATTTTTGTCTTTATGCTTTCATGTTGCCCTGACTGTTTCCCCTTTATGCAGATTCTGGAGGTGAAATGGCCAACACAAGCTCTGATACTTTGGATAGTTCAACTGTTCAGGAAAAACCAGTGGTTCCGGGACACATCATCTCTGAAATCAGTTCTCATGTTCAAAAGGAAGAGTCTGCTGTGTCCAAAAGACGCTCTAACAATGAACCATCTCTTTGCATTGCTGTAATTGGAGCTACTGGTGAGCTGGCAAGAACTAAAGTTTTTCCAGCATTATTTGCTCTGTATTACAGTGGTTTTCTTCCTCGGGTATGAACATAGAATAACTTCTGCTACTGTCATTTTCATGTCACACCTTTCATTTTCATTTTTATGCTGCAGAATGTTGGTATATTTGGGTATTCTAGGAAGAAATTGACAGATGAGGGCTTAAGATCTATAATTGAAGCCAATTTGACCTGCCGGGTGGATCACCAGTATGTTATTTGGCAACTTTCCATATGATAATTATTGTGATGGCAGTTGCATTGACAAAATAAAAAAATAGCACCACATTTAGTATCTATACTATTTCCTTTATAGCTTTGAGATTAATATAAATAATTATTATAGCCAACCCATTCTTATGATGCCTTTAATAAGCTGCACAGCATGGTTTTAGACCAAACGATCTGTTGTTTAGGTTGGTGCTTGACACCACTTCGCTTCTTCCAAAGTTTTTGGTGCATGCACTAACATAGTTTTTCTGTCATTTTAAAAATAGTTTTACTGTCGTAGAAAAAAAGGCTTTACCAAACTAAGAAGAATGTGTTCTGATGTTTATTGTGAATGCAGTGAAAATTGTGATGACAAGCTAATTGAGTTCCTCAAAAAGACGTATTA

Transcript:

>GRMZM2G426964_T01

CDS:

Protein:

4.Chromatin states

States in Promoter (2kb)	States in Genebody	States in Downstream (2kb)
E22,E22,E14	E22,E23,E26,E18,E25,E13,E6,E11	E11,E23,E37

5.Protein domain

Protein ID	Pfam Accession	Pfam Annotation	Alignment Start	Alignment Start	E-value
GRMZM2G426964_P01	PF00479.19	G6PD_N	3	93	6.30E-22
GRMZM2G426964_P01	PF02781.13	G6PD_C	96	380	1.30E-90

6.Blast top3 hits

Species	Gene ID	Blast Evalue
Arabidopsis thaliana	AT1G09420	0
Arabidopsis thaliana	AT1G24280	1.00E-158
Arabidopsis thaliana	AT5G13110	3.00E-157
Oryza sative	LOC_Os03g20300	0
Oryza sative	LOC_Os07g22350	4.00E-157
Oryza sative	LOC_Os03g29950	7.00E-155

7.Heuristic function module

Category	Family
KEGG pathway	zma00030
KEGG pathway	zma00480
KEGG module	zma_M00004
KEGG module	zma_M00006
GO	GO:0016491
GO	GO:0000166
GO	GO:0050661
GO	GO:0004345
GO	GO:0006098
GO	GO:0005975
GO	GO:0055114
GO	GO:0006006
Subcellular location	mitochondrion
Subcellular location	plastid

8.Predicted function module

Category	Family
null	null