Gene Detail

1.Annotation (Gramene)

Annotation: Uncharacterized protein

2.Location

Chromosome	Strand	Region	Start	End	UCSC
9	+	gene	155361528	155366191	LINK

3.Sequences

Gene:

>GRMZM5G828278

GCAGTACAGCAGAGCAAAGCAAAGAGGAACACCATTTCCCTTGCCTGCTTGCCAACCCACCACCACCACCACCACCACCCACGAAGGCAGCAGCAACCCAGCACCACCGATCCATCCATCCACTCGTCATTCCTCCGCCCCGCCGCTCGCCTTCACCCATCTCCGACCCCGCTCCGCCACCAAACCCTAGGCTACCAGCTCTTCCCACCCCGTGTGCTCCGCTCCCCTGAGGGCGGCTCGCGCGCCATTTCTCCGCTCGATTTCCTAAAACCGTACTCTCGGATTCGGGATCGGGCCGCGACGGGGCCTCCTCTTGCTCTCGCTCTTCCGTCCGGTCGGCCGCTGAGGACAATAAAGGAGGTTGCGCTCATGCCGGGGGCGCCGCTCAGGTGACTTGCTGGGGGGCCATGCATAGGTACTCCAGCAACAGCGCTGGGTTCAGCGGTGGCAGGGACGGCGCGAGGTTGGAAGCCTCGCCCTTCTCGTCCTCCTCCTCTGGGTACCCTGTCAGCTCCAGGTGACACTCCAACCCCCGCTCCCTTGTTTCCCTGTCCAATTTGATCTGCATGGTCAGGCGTTTTAAACGACGGCTGCCATTGGTAACTTATTTGATTAGTGTAGTTGCTGAGTAGGCACTGTGGCACGACGCAGTAACCCCTTCGGAGTTCGGATTAGGCAGTCACCTCTTTCGCAACTGTAATGCCAGGTGTCCTTGTTCGTGCGTGCAGACATCTTCAAGGCTATTTTGTCAGCAGGATTTGTGTTTCATCCTCGAAATAGAAACTGCTATCCATCTCTGCCCTCAATAAAGTAGCCTGTCACAGACCGTTTTATTTTTAACAAGTGGAAAGTCCATTCTATGAATGAACATATATAGCTTGGAATGCGCGCATTGTTCTCTACTTGCTTCGTCCTCTGAATAACTTCCGTGTTGAACATTTCCGCTTATTTCATATCATAATCACATGATGCAACCACCTATGCGAATGCATTCCCTGTGGATACATTATTTCAAAAGTCTGAATGGCATGCTCATCACTGTTAGTCTGTTATTTCTGTTCACATGTTTTGTAAACTTCCCATGTCTACCATATAATAACTAGAAGATATGTATCACTTGAAGTTAGATATAATTGTGCCACATTCACTCGCTTGTTTGGAATGAGGTGCTGTGGTGCAGTAGGAAGTAGTATCGACCTCACTTCCAGTACTCTATTTCTTGTTTATATTTTGCTTGTGCATTTTTCTTCCCACAGTGGTGATTCTGATATCTTTTTCTCCCTAACACCCCTGTCTTTCAGGCGGCAGCAGCAGCTAGTTCCATACAAGCTAAAGTGTGACAAAGATCCACTTAATAACAAGTATGTCTAACTTATCGACCAAAGCCACTTCACATCAATGAGAGAGCTAACGACTCTTCTCCTATTTGCATGTTTTTTTTTTAATCTCAGACTGGTTATGATTCTCTTCCTTTTTTTGGCCACCCCTATCAGCTTTGACATGATATCTGCTTATAAAACGACGATTTCATATATTGTTCTTCTATTTATAACTAAGAACTGTTGATTTGTCCCACGATATGGTTTCGTTGGATCCTTGTTGCTCCTTTTACATGTCTCTTCTGTAGGCTTGGGCCACCTGACTTCTATCCACAAACACCAAACTGTCCCGAAGAGACATTAACCAAAGAGTATGCACAAGCTGGGTACAAGGAGACTGTTGAAGGAATTGAGGTGTGTATGGAAACAGAAGCTGTACACAGCACATTATGGACATTATGCTACCCCCCCAGCCATACTTTTAGGAGTTTAGACAATTATAATCTCTTATTTGGTATTGCATTAATCTATCCTTTGCTTTCACTTGCACAGTTTGGACATATTACAACAGTATAGTGCATTGACTGAAATTAAATTTTCCTGAGCTTGATAGGAAGCAAGAGAGATTGTACTCAGCCAGATCCCGTACTTCTGTAAGCCAGATGCTGTCATAAAGTGCAAGGAGGTAAGGAAAATCCGTCTATATCTAGTGAATTACTTGTAAGGCAATCCTGTTTTTCCATTATGATTGTGACGCAGAAGTTTGTTTTCTTATTCACAAGAAATGCTACTTTCTGTAAAAAGAGAAGGCAGAATGGATATTCAGGCTAAGGAAATGCTATAATTATTTTTCATGTAGAATTGTTTTTTTCATGGCTTCAAGACATTTGACATTCCCATCCATGCCCTGTTTTTGTATTTTAATCCCATGCCAACTTGCGATTGGTCATGCTATTTGATACTCTTCACAGATAATTGAAACAAATATTTTCTTGCTTTGTACATGAAGTGTGCTGGGCCAATAACATTGCATTATATGTTCTACTAATTTTTGTTTACCGGCCCTAGAACAGACTGCTTTTGTGGCATCTTGTTTCTAACATACTGTACTAAGACACTCCTGTGGTACCCTGAAAGAATTTCTGATGAAAAGTTCACTTTTGGGCTTTTGGCACTCTTGTTTCTAATATACTGTACTAAGGCTGTAATGCTTGAAATTGATGTATTGCGGTTATTGGAATGAAGAAATAGCATAGATTTCAGTTTGTCAACTTCCTTAGTTCGTTGTTTTTATTGTGGGCCCCTTCGCGTTTGATTTTCTTCTTTCATGTTTTGATATTCACATCATGTAGACCTGCACATTGTACTGAATGTACTGCATAGATTTGTGTTTTCCTCTTAAGGTGTTGTTAAGTCTTCCAGGCTGGTGGATAGTGGATGTAACCTTCTTGTTGGAATATGGTCTAATAATTTATCTTATCTTCTTCAAACCTTCTTTCCCCTTCCCTTCTTCTTTTCTTTTTTTGTATGGTTTCTCAGATAAGGCTGTAACTAACACTTCGCTGTGCTCATTTTTTGATGAAGGCACTAAAGAAGCGTTTAAGAGCGATCAATGAATCTCGTGCTCAAAAGAGAAAGGTATTTGTTCTGTATTTTCTTTAGTACTGGTGCCTGTAAAAATATAACCCCTCCTATTACATGATATTGTGTTAAACATAAAAAACTGATGCTCTTTCTTTCTCAACAGGCTGGCCAAGTTTATGGAGTTCCTCTTTCTGGATCTCTACTGATCAAGCCTGGAGTTTACCCAGAGCAAAGACCATGTAATGAGGACGCCCGCAGAAAATGGATTGAGGTCGAGCAGACTGACCTGTCATTTGTTGTTATAATATAATGTTTTGTTCAATAGAACCTTGGTAAATATTTCATGTTTGTTATCTAAGTTTGCAAATTTTTAAGCTTGCTTTCGCTTGAAAGTTAGATGTTTGGCTTCCTTTTGAGTATTTGATTGATAGTGTACTGCTAGAATAACAGCTAAGGACATATGACCATTCTTACTGTGAGGTTGCTTTTGGCATTTAAAATCTTGAACAGCATTGTTACTTGGGACAGCGAGCATTGGCCTTTTTCACATGTTTCATCTGTGGAATTCAAAGTTATTCAGCTTGGAATATTCGATTTATGGTGCTGAATGATGTTTTTTACTTTGTTATGCTGGTGCTGCAGCAATGAGCTCAGTTTGCTTACATTCATTAGTTTTCTTTCTTTACATCCATTATTGCCTTGCAGGCCCTTGCTCAGCCAAACAAGCGACTGCGTTCATTGTCTGAGCACGTTCCTCATGGTTACCGTAGGAAATCACTTTTTGAAGGTCTAATTCGATATAATGTTCCGTTGCTAAGAGCAACATGGTTTATTAAAGTCACATACCTGAACCAGGTTTGGAATCTCTTGTACCCTTCTCTTATTTACTATCAAATGCCACATTGCACCATTGTGATGATGTGTATTCAATTTTATATAGCTACAGACCCGACAGACACCTAACAGTATTTCAGTAGCGGGTTCTGATAACCAACGCTCTAATCAGTGGACAAAGGATGTTGTTGAATATTTACAACATATTTTGGACGAATTTTGTTCTAAAGAGGGTGCATTCGTGCATCCATCTTTTAGAGAGCAGTCATCACCAGGACCTACTGCTGGAACCAATCAGATAAAAATGAAAACTGAAGCATCTCCAGCTGCTGGAGACATTGAAGAACCCTTGGTGCACTTCAAATGGCGGTATATGGTTCGTCTCATCCAATGGCATCTCACAGAAGAATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAGGTACTTCTGTCGAGAATTCAATTGACGTGAAAGTTTATGTTTCAGTTCCTATTCATCTATTGAAATTATTGATCTATTTATCTCCTTTGTTCAGGAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGTCTGGTTGACACCATTACTCTCTCACAAACATATGTGCGCATGTTTGTGGAGCTACTAGTGAGACGTCTCAATGATGCTTCTGTTGTTGATAGTCCAAAAGGACCTTCAGTTTCTTCTGTTATAGCAGAGTTACTGCGGTACATGGTACTTGCAGTGCCAGATACATTTATTTCTTTGGATTGCTTTCCTCTCCCATCTTTTGTGGTTCCTGATGTATATGGTAGAGGTGCTTTGTTGAAGATAACTAGCAGTGGTGGAATTTCAAGTTCTAAAAGGTGTGATGCTTATCGGTATTTGTCCTGTGGTTATGCTGTTTGTTCAATTC

Promoter(up TSS 3kb):

>GRMZM5G828278_promoter

AATCTCAAGTACCGAGTATAGGATCTGTTTGGAACAACTTTTTTCTAAAGAATTTTCTGAGTATATAGATTCCTTGATAAGCCAGCTGTCACAAGAATCTAGATATTAGAGTTTAGGAGGCGACATATTCCTTCTATCGCGATGACTCGATGAATTCTGCATCTATATTATACGAATTTTGGGTCCATTCTTAGGTAGATAAGATAGCCACGTATCTTGAAAACACACAACTGTACGATGATGCTAGAACGGTCGATCGCGAGATTATGGACTTTCTCAGTGTATGTCCACCGATGAACAAACCAACCAGCCATCCTTGCATACTCCATTTCCAAAAATCAACTAGCTTATTCTCTTCGCTTTGATCCGTACCGACTTCTACTGCTTCTACAATGTTTTGTCTCTATGAATTGCAGTTGTAACAGTCCGAACAACTAGCTTTAAGCTGAAGCGAACAAAATAACATTGCAGGTATGAATCAATTTTCGCACATGTGTCTCTAATTCCTATCAACATCGACTCCCCATATTCTCGAAGTTGGTGAAATCTCACATCCTGATCTCATCTTTAGACCAGTCACCTCCTCTGATTTTCCTCCCTAGATCTCGTTTGGCTCTAATGATCCCAAATCTCATCACCACCAGCACGTGCTCCCCCTCCAAATCCCATCAACACAACCCCCAAATCTTGTCAACCCAAATTCCCCTCCTCAAATACGATTTTCTTAGGCAGCCCCTAGACAAGGTCCCAACGCGAGTGACGTCGCGCAAGTCACCGATGCGAGTCCCTTGGCGTGGTAGTGTGGTACGACACTGGCGTAGGCCCCTAGCATTGACAAGCTGGCAAGGCAATAGGCTCAAGGCACGACGGCTACTCTATGGAACCTGATGAGGACATCCTCCACTATTACTCGTTCACAAAGACACAATTTATCCCAGTTGGCCCAATTGTAGTCGGGTGGCGACCGTGTGAGCCTCAAAATTATCCTACCTTGCTTAACTTGAAAAGAGGAAGCCACCTTAAAAGGGAGAGCCGCCCTTCCCCCATCAGGCTAGTCTTTTGGGGCAATTGGGACTTTCTTTGAGTTGGATGTGCTTAATTAAATGTTGGGCTTCGGGCAACCCTAATTTGTTGGGACTCGGCCAACCCCACCTGGCTGGGTGTATTATCTGGTATCAGAGCTAGGGCCCATTTTAAAAAGGTGGGAATGATGAGAACATCATCCACTATTACCCGTTGTCAAAGACACAATTGACCCAGTTGGTCTAATTATAGTCTAGCAATGACCGTGTAAGCCTCAGAATTATCCTACCTTACTTAACTTGGGATGAGGAAGCCACCTTAAAAGGGAGAACCACCCCCATCAAAACCTTTTCTTAAGTTGGTTGTGCTTAATAAACTGCTGGGCTCTAGACAACCCTAATTTGTTAGGTCTTGGCTAACCTCACACTGGGTGTATCATAACCTAGCAAGGTTGCTCGTTTATCGGCAACAATCTAGCTGTTAGGGAAACACGAGATCAGCCGGTGGCAATGTCGAACCAGATTTCGACTTTGAGCTCGAGATGGACAACACGTGGATGCGCACCATGTGTTCTTCGATGTAATGCTATCAAGAGGAAAGAGACTTGCGCTCTAATACGTTTCCTTTATTTTCCTATTCATCCCTAGTACATAATGGATGTCTTATCCTGACCAACACATTTTCTTTATCCGGTTTAAACCAAACAATAATAGATGTTTTTTACCGTGTTCCTTCAAAATAGAAAAATTATACCAATACAATTTCTGCCAACACTTTTACTTTGCTCACTCTACTCTATTTCTTTGATAAGTTTAAACTTGGCTCTGCTCATGATCTCATCTGGTTATTTTGTCTCACAAAACTTTTTCTCAACAAGAAACAATTGATGACAATGATGATCTTCTACAGAAAATTAGAAGGATCTACCCTCAAACTAAAAGCAAAAAATGCTGCATGATATAACCCAAAAAGTCAAATTAAAGTAGTAGACTTTAGAAGTCCTTTTGACTAGTACAATATTTCTATAACTTTTGTTTACTTGAACACCAATAATGGTGCATCTTTTGATGTATATAAGTATGTAGCTATATGGTGTCAATCTTATGTTATAAACCAACAAAACATAAGTAGTAATCTCCAGCAAATATTTCCGTTAGTATTTTGCAATTGAGTTACTAAGGTAGGATGTATTGATGTCTCTATCCCTTTAAGGACACTCTTATGTCCAACATTCATCTTTTTTCTACACATAAATATTGTGCAGCAGCGTGACAACGCCGCACGTCGTTTTCTAGTTCACGTTAATTTGAGGTATTTTTCTTATAGAAGCAATTTTAAAAAAGCATGCTGAAAAGTGAAATTTTTAGTTATTACAGAAGTTAAAATAATTGGAGCAATAATACCTTGTGTGTTGTCCCTCTCCGGCACACTCTCATGTCTCGTGATCTCGTTCGCACGTCCATCACATCCATAAACTAATTATGACAACTAAAATCTATATGTAAACCAAAAGGGACAATAATACCTTATAGGTCTGTTTGGTTGGTTTTTCTCGCCAACCTGGTTGTGTGAGCTAGGATCACTGGAGCCTGGCTCTGGAGATGCGACCAATCTGCTCGTATCTGGTGAGCCTGGCTCAGGGTGCTTTAAGGATCGTGTGAGCCTGGATCCAAATCTACATGCAGACAACCAAACACAGAGCTCGCACGCGCATAGCCTGCCTCACAGCAACCAAACAACAGCTACCCACATCCTGTAATACAAGCGCGCGCAGATGCAGACAACCAAACATACCCATTGTGTTGCTTCTCCTCCTCGGGCACACTCTCGTGCGCGCCCACCACGCCCACAAATTCAGCTACTCTTGTCCTGACGATCACGGCCACGGAGGGAGGGAGAGTCAACGGTCAGTGCGGGGGCTATGGTTTGCTTTCTTCCCCCGAGCGCAAGCGCAACCCCCGCACCAAACAGACAACA

Transcript:

>GRMZM5G828278_T02

>GRMZM5G828278_T01

CDS:

Protein:

4.Chromatin states

States in Promoter (2kb)	States in Genebody	States in Downstream (2kb)
E11,E23,E11,E3,E4,	E4,E5,E7,E22,E21,	E21,E14,E22,

5.Protein domain

Protein ID	Pfam Accession	Pfam Annotation	Alignment Start	Alignment Start	E-value
GRMZM5G828278_P02	PF09497.7	Med12	154	214	2.10E-21

6.Blast top3 hits

Species	Gene ID	Blast Evalue
Arabidopsis thaliana	AT4G00450	3.00E-16
Arabidopsis thaliana	AT3G12810	0.009
Arabidopsis thaliana	AT3G08950	3.8
Oryza sative	LOC_Os07g45400	2.00E-84
Oryza sative	LOC_Os10g40260	5.00E-72
Oryza sative	LOC_Os01g13060	5.4

7.Heuristic function module

Category	Family
GO	GO:0001104
GO	GO:0016592
GO	GO:0006357
Subcellular location	cytosol
Subcellular location	endoplasmic reticulum
Subcellular location	golgi
Subcellular location	nucleus
Subcellular location	plastid
Subcellular location	vacuole

8.Predicted function module

Category	Family
Mo17 tissue specific network	MO17RALLCFM292