Gene detail

Solyc02g072160.2's detail annotation

Phytozome annotation

	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein

NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein

Network

Network Category	Global Network	Tissue Preferential Network	Stress differential network
Coexpression Positive	Top300 PCC genelist	Top300 PCC genelist	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Top300 PCC genelist	Top300 PCC genelist	Top300 PCC genelist
PPI relationship	null
miRNA-target relationship	null

Functional module

Module ID	Function Annotation	Category
CFinderADM000462	alanyl-tRNA aminoacylation protein import glutamate biosynthetic process tRNA aminoacylation alanine-tRNA ligase activity glutamate synthase activity ATP binding oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors Nitrogen_metabolism	global network

Location information

Gene	Assembly	Sources	Chr	Start	End	Strand
Solyc02g072160.2	SL2.40	phytozomev10	SL2.40ch02	36050355	36058273	+

Gene structure and chromatin state

more details in UCSC

details of chromatin state

Sequences

Gene:
>Solyc02g072160.2
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Transcript:
Solyc02g072160.2.1
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CDS:
Solyc02g072160.2.1
ATGAACCCGGAAAGGAAGCCACAGGAGCAGGAGTGGAGAGAAAGCGAAAGAGGAAAGTTGGCTTTTGGGAAGATGGAATCTTGTTATTTCTCTGTAACAAAGCCATCATCATCTTCAACTATTCTGAATTTTCAGGGTGTTTCATCTCTTGGTGGTAGATCGTCTCAGAAATCCTTAGGTGCCCCATCTCATCTTTCCTGGCCATTATCTGGACCTAATAAGAAAAGTCAAAATTTTGTTTATAGGCGGAAGACGTTTAAGGGACCCATATTGGCAGAAGCTGGAAAACAAGTTAACTCGATGGATTCTTCTGGAATTACCCTGGTAACTGGAGCCACTGGTGGTGTTGGGAGAAGAGTGGTGGACGTATTACGCAACAAGAAACTGTCTGTCCGAGTACTCGTCAGAAATGAAGAGAAGGCAAGAAGAATGCTTGGTGAAGATGTTGACCTGGTTGTTGGAGATGTTACCAAAGCAAGCACTCTGCTTCCTGAGTACTTCAAAGGGATAACAAGCGTAATTAATGCTGTTTCTGTCATTGTTGGCCCGAAGGAAGGGGATACCCCTGACAGGGAAAAATACAGTCAGGGAATCAAGTTCTTTGAACCCGAGATTAAAGGTGATTCACCTGAAATGGTGGAGTACGTTGGAATGAAGAATTTAATAAATGCTGTTAAAAAAAATCTTGGCATTCGCACAGGAAAACTACTATTTGGATATGAAGGTAATTCATTTAAAGAACTTCCTTGGGGTGCTTTGGATGATGTTGTGATGGGTGGAGTGAGTCAAAGTACATTCCAGATAGATCTAACTGGTGGGGAGAATGGTGGACCAACAGGACTTTTCAAAGGTGTTGTTACCACGGCTAATAATGGGGGGTTTGCCAGTATTAGGACAAAGAACTTTTCTGAACCCGAAGACCTTTCTGCTTATGATGGCTTAGAGTTGCGCCTTAAAGGTGATGGCCGTCGTTATAAGCTTATTGTTCGCACTAGCAGTGATTGGGATACTGTGGGTTATACAGCAATCTTCGATACCGTCGAGGGTTGGCAATCGGTCCGTTTGCCCTTTTCTTCTTTGAGGCCTATATTCCGTGCACGAACCGTACTAGATGCATCACCTTTTGACCCCAGTCAAATCACATCATTACAGCTTATGTTCAGCAAATTCGAATCTGATGGTAAACTGAATCCAACATTCAAAGAAGGTCCTTTTGAACTTCCTGTATCATGCATTCGAGCGTATCTTAAAGATCCCATAACTCCCAGGTTTGTACATGTGAGTTCTGCTGGTGTAACTCGACCAGAAAGACCAGGAATTGATTTAAGCAAACAGCCTCCAGCTGTGCGATTGAACAAGGAATTGGGCTTCATCCTGACATTCAAGTTAAAGGGGGAGGATGAGATTCGAGAATCTGGGATACCATATACAATAGTCAGACCTTGTGCCTTAACTGAGGAGCCTGCAGGAGCTGATCTCATTTTCGATCAAGGCGACAATATCACGGGGAAGATATCCCGTGAAGAAGTTGCTCGAATATGTGTGGCCGCTCTGAAAAGCCCCTATGCATGTGACAAGACATTTGAGGTTAAAAGTGTCATTCCATTTAGTGAGCCGTACACGGTGGATCCAGAAAACCCTCCTCCAGAGAAGGATTACAATGAATTCTTCAAGACTCTGAAAGATGGCATCACTGGGAAAGAAAGCCTCGAGAAAACACCGATCTCTGTATAA
Protein:
Solyc02g072160.2.1
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Gene:

>Solyc02g072160.2

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Transcript:

CDS:

Protein:

Top hits annotation

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Nicotiana tabacum	gene_67860	6.00E-129	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30
Nicotiana tabacum	gene_67859	2.00E-134	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30
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Nicotiana tabacum	gene_66743	2.00E-134	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30
Nicotiana tabacum	gene_58369	7.00E-129	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30
Nicotiana tabacum	gene_23503	4.00E-84	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30
Nicotiana benthamiana(v0.44)	NbS00058766g0002.1	4.00E-147	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30 (AHRD V1 **-- B2IZH1_NOSP7)
Nicotiana benthamiana(v0.44)	NbS00001976g0003.1	0	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30 (AHRD V1 **-- B2IZH1_NOSP7)
Nicotiana benthamiana(v0.44)	NbS00010336g0003.1	1.00E-55	NADH ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30 (AHRD V1 **-- B2IZH1_NOSP7)
Capsicum annuum	Capang02g001473	0
Capsicum annuum	Capana02g001645	0
Capsicum annuum	CA02g13470	0	UOS1
Nicotiana benthamiana(v1.01)	Niben101Scf10268g00007.1	0	NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30 [Fischerella sp. PCC 9339]
Nicotiana benthamiana(v1.01)	Niben101Scf00581g03001.1	0	NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30 [Fischerella sp. PCC 9339]
Solanum pennellii	Sopen02g021140.2	0	Complex I intermediate-associated protein 30 (CIA30)
Solanum pennellii	Sopen02g021140.1	0	Complex I intermediate-associated protein 30 (CIA30)
Petunia axillaris	Peaxi162Scf00202g01112.1	0	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
Petunia inflata	Peinf101Scf02105g00008.1	0	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID
-	-	-	-	-

PlantCyC

Enzyme ID	Description	Pathway	Pathway id
-	-	-	-

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0003824	catalytic activity	molecular_function
GO:0050662	coenzyme binding	molecular_function
GO:0044237	cellular metabolic process	biological_process

Pfam Domain

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end
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PF13460.2	NAD_binding_10	416	519

Expression pattern

1. Expression trend for Solyc02g072160.2 global RNA-seq network

2. Expression trend for Solyc02g072160.2 tissue preferential conditional network

3. Expression trend for Solyc02g072160.2 stress differential conditional network

4. Expression trend for Solyc02g072160.2 in different samples during fruit ripening

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