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Solyc07g043310.2's detail annotation

Phytozome annotation

	Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein

Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein

Network

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Functional module

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Location information

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Gene structure and chromatin state

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details of chromatin state

Sequences

Gene:
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Nicotiana benthamiana(v0.44)	NbS00019347g0004.1	0	Aminotransferase (AHRD V1 ***- D2KZ08_WHEAT)
Nicotiana benthamiana(v0.44)	NbS00028397g0018.1	0	Aminotransferase (AHRD V1 ***- D2KZ08_WHEAT)
Solanum tuberosum	PGSC0003DMP400041999	0	Clathrin assembly protein
Capsicum annuum	Capang09g000389	0
Capsicum annuum	Capang03g001335	2E-161
Capsicum annuum	Capang07g001140	6E-129
Capsicum annuum	Capana03g001399	2.00E-161
Capsicum annuum	Capana09g000427	4.00E-129
Capsicum annuum	Capana07g001086	6.00E-67
Capsicum annuum	CA09g14690	0	Gamma aminobutyrate transaminase 3, chloroplastic
Capsicum annuum	CA03g08530	0	Putative aminotransferase
Capsicum annuum	CA09g14710	4.00E-75	Gamma aminobutyrate transaminase 3, chloroplastic
Nicotiana benthamiana(v1.01)	Niben101Scf02807g11007.1	1.00E-162	Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein LENGTH=513
Nicotiana benthamiana(v1.01)	Niben101Scf12662g00012.1	1.00E-117	Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein LENGTH=513
Nicotiana benthamiana(v1.01)	Niben101Scf06933g02004.1	1.00E-102	Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein LENGTH=513
Solanum pennellii	Sopen07g022870.1	0	Aminotransferase class-III
Solanum pennellii	Sopen12g002390.1	0	Aminotransferase class-III
Solanum pennellii	Sopen08g005600.1	0	Aminotransferase class-III
Petunia axillaris	Peaxi162Scf00047g02451.1	1.00E-131	Gamma aminobutyrate transaminase 1, mitochondrial
Petunia axillaris	Peaxi162Scf00393g00517.1	2.00E-130	Gamma aminobutyrate transaminase 2
Petunia axillaris	Peaxi162Scf00047g02452.1	8.00E-114	Gamma aminobutyrate transaminase 1, mitochondrial
Petunia inflata	Peinf101Scf04351g00016.1	0	Gamma aminobutyrate transaminase 1, mitochondrial
Petunia inflata	Peinf101Scf02326g02034.1	0	Gamma aminobutyrate transaminase 1, mitochondrial
Petunia inflata	Peinf101Scf00838g06016.1	4.00E-149	Gamma aminobutyrate transaminase 1, mitochondrial

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID
K16871	GABA-TP1;gamma-aminobutyrate transaminase subunit precursor isozyme 1	EC:2.6.1.96	Butanoate metabolism	sly00650
K16871		EC:2.6.1.96	Alanine, aspartate and glutamate metabolism	sly00250

PlantCyC

Enzyme ID	Description	Pathway	Pathway id
EC-2.6.1.19	4-aminobutyrate transaminase	4-aminobutyrate degradation	PWY-6535
EC-2.6.1.96	4-aminobutyrate--pyruvate transaminase	glutamate degradation IV	PWY-4321
EC-2.6.1.19	4-aminobutyrate transaminase	glutamate degradation IV	PWY-4321
EC-2.6.1.96	4-aminobutyrate--pyruvate transaminase	4-aminobutyrate degradation IV	PWY-6473

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0008483	transaminase activity	molecular_function
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding	molecular_function

Pfam Domain

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end
PF00202.17	Aminotran_3	84	501

Expression pattern

1. Expression trend for Solyc07g043310.2 global RNA-seq network

2. Expression trend for Solyc07g043310.2 tissue preferential conditional network

3. Expression trend for Solyc07g043310.2 stress differential conditional network

4. Expression trend for Solyc07g043310.2 in different samples during fruit ripening

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